ДНК-маркеры и их использование в отечественном овцеводстве
Аннотация
В обзоре проведен анализ последних достижений применения ДНК-маркеров в отечественном овцеводстве. С помощью микросателлитов оценено состояние аллелофонда, рассчитаны параметры генетического разнообразия, изучена популяционная структура пород овец (Е.А. Гладырь с соавт., 2013; Т.Е. Денискова с соавт., 2016; С.В. Бекетов с соавт., 2022; А.В. Иванникова с соавт., 2023; В.С. Матюков с соавт., 2022, 2023). Изучены связи вариантов генов CAST, GH, IGF-1 с мясными качествами отечественных пород (Н.В. Широкова с соавт., 2018; В.П. Лушников с соавт., 2020; И.Ф. Горлов с соавт., 2021; А.А. Оздемиров с соавт., 2021; А.Я. Куликова, 2023; А.И. Суров с соавт., 2023). Показана связь аллельных вариантов генов PRL и β-LG с молочной продуктивностью (М.И. Селионова с соавт., 2020; Д.Д. Евлагина, М. И. Селионова, 2022). Изучен полиморфизм в генах KAP1.3 (Р.Ю. Сенина с соавт., 2019; З.К. Гаджиев с соавт., 2023) и KRT1.2 (О.Л. Халина с соавт., 2023). Проведен анализ аллельных вариантов в генах GDF9, BMP15 и BMP15B у представителей дагестанской горной, манычского мериноса и романовской породы (З.К. Гаджиев с соавт., 2023; Е.А. Климанова, Т.В. Коновалова, 2023; Т.Е. Денискова с соавт., 2023). GWAS позволил выявить SNP, достоверно ассоциированные с живой массой у овец из ресурсной популяции (Т.Е. Денискова с соавт., 2018). Создана платформа GWAS-MAP|ovis для хранения и анализа статистик GWAS по мясной продуктивности (А.В. Кириченко с соавт., 2022). Выявлены достоверные ассоциации SNP с мясными качествами и экстерьером у джалгинского мериноса (А.Ю. Криворучко с соавт., 2022), северокавказской мясошерстной (Р.В. Зуев с соавт., 2023) и российского мясного мериноса (А.Ю. Криворучко с соавт., 2023; Е.Ю. Сафарян с соавт., 2023). У 16 пород выявлены регионы вариаций числа копий (A.V. Igoshin et al, 2022). Проведена оценка материнской изменчивости 25 пород на основе анализа полиморфизма гена CytB (О.А. Кошкина с соавт., 2021). Проведено исследование мтДНК овец из различных регионов России (O. Koshkina et al., 2023). Для успешного развития овцеводства необходимо расширить внедрение молекулярно-генетических подходов в селекции.
Ключевые слова
Об авторах
О. А. КошкинаРоссия
Т. Е. Денискова
Россия
Список литературы
1. Zhong Y., Tang Z., Huang L., Wang D., Lu Z. Genetic diversity of Procambarus clarkii populations based on mitochondrial DNA and microsatellite markers in different areas of Guangxi, China // Mitochondrial DNA. Part A, DNA mapping, sequencing, and analysis. – 2020. – Vol.31. – №2. – P.: 48-56. (doi:10.1080/24701394.2020.1721484).
2. The state of food and agriculture, Rome, 2016. [Электронный ресурс]. Дата обращения: 02.03.2024. URL: https://www.fao.org/3/a-i6030e.pdf
3. SanCristobal M., Chevalet C., Haley C.S., Joosten R., Rattink A.P., Harlizius B., Groenen M.A., Amigues Y., Boscher M.Y., Russell G., Law A., Davoli R., Russo V., Désautés C., Alderson L., Fimland E., Bagga M., Delgado J. V., Vega-Pla J. L., Martinez A.M., Cardellino R. Genetic diversity within and between European pig breeds using microsatellite markers // Animal genetics. – 2006. – Vol. 37. – №3. – P.: 189-198. (doi:10.1111/j.1365-2052.2005.01385.x).
4. Tautz D. Notes on the definition and nomenclature of tandemly repetitive DNA sequences // EXS. – 1993. – Vol. 67. – P.: 21-28 (doi:10.1007/978-3-0348-8583-6_2).
5. Clarke S.M., Henry H.M., Dodds K.G., Jowett T.W.D., Manley T.R., Anderson R.M., Mc Ewan J.C. A high throughput single nucleotide polymorphism multiplex assay for parentage assignment in New Zealand sheep // PLoS ONE. – 2014. – Vol. 9. – №4. – P.: e93392 (doi:10.1371/journal.pone.0093392).
6. Харзинова В.Р., Петров С.Н., Доцев А.В., Безбородова Н.А., Зиновьева Н.А. Популяционно-генетическая характеристика некоторых пород коз на основе анализа микросателлитов // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2019. – № 3. – С. 7-11.
7. Денискова Т.Е., Сермягин А.А., Багиров В.А., Охлопков И.М., Гладырь Е.А., Иванов Р.В., Брем Г., Зиновьева Н.А. Сравнительное исследование информативности STR и SNP маркеров для внутривидовой и межвидовой дифференциации рода Ovis // Генетика. – 2016. – Т.52. – №1. –P.: 90. (doi:10.7868/S0016675816010021)
8. Chekirov K.B., Isakova Z.T., Kipen V N., Irsaliev M.I., Mukeeva S.B., Aitbaev K.A., Sharshenalieva G.A., Beyshenalieva S.B., Kydyralieva B.U. Differentiation of Bos grunniens and Bos taurus based on STR locus polymorphism // Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii. – 2023. – Vol.27. – №5. – P.: 488–494. (doi:10.18699/VJGB-23-59).
9. Волкова В.В., Денискова Т.Е., Романенкова О.С., Костюнина О.В., Суетина Н.П., Зиновьева Н.А. Генетическая характеристика красной горбатовской и суксунской пород крупного рогатого скота по микросателлитным маркерам // Молочное и мясное скотоводство. – 2017. –№ 6.– P.: 6-8.
10. Столповский Ю.А., Бекетов С.В., Солоднева Е.В., Абсаликов В.М., Абдельманова А.С., Гладырь Е.А., Зиновьева Н.А. Генетическая структура аборигенного тагильского скота по STR- и SNP-маркерам // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – Т.56 – №6. – P.: 1123-1133 (doi:10.15389/agrobiology.2021.6.1123rus).
11. Харзинова В.Р., Зиновьева Н.А. Паттерн генетического разнообразия у локальных и коммерческих пород свиней на основе анализа микросателлитов // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2020 – Т. 24–№7. – P.: 747-754 (doi:10.18699/VJ20.669).
12. INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETIC. [Электронный ресурс]. Дата обращения: 02.03.2024. URL: https://www.isag.us.
13. Solodneva E., Svishcheva G., Smolnikov R., Bazhenov S., Konorov E., Mukhina V., Stolpovsky Y. Genetic Structure Analysis of 155 Transboundary and Local Populations of Cattle (Bos taurus, Bos indicus and Bos grunniens) Based on STR Markers // International journal of molecular sciences. – 2023. – Vol. 24 – № 5. – P.: 5061 (doi:10.3390/ijms24055061).
14. Петров С.Н., Денискова Т.Е., Доцев А.В. Генетическая характеристика представителей рода Capra с использованием STR-маркеров // Достижения науки и техники АПК. – 2023. – Т. 37 – №9. – P.: 74-79.
15. Radko A., Koseniuk A., Smołucha G. Genetic Diversity and Population Structure of the Native Pulawska and Three Commercial Pig Breeds Based on Microsatellite Markers // Genes. – 2023. – Vol. 14 – №2. – P.: 276 (doi:10.3390/genes14020276).
16. Vignal A., Milan D., SanCristobal M., Eggen A. A review on SNP and other types of molecular markers and their use in animal genetics // Genetics, selection, evolution: GSE. – 2002. – №34. – P.: 275–305 (doi: 10.1186/1297-9686-34-3-275).
17. Iso-Touru T., Tapio M., Vilkki J., Kiseleva T., Ammosov I., Ivanova Z., Popov R., Ozerov M., Kantanen J. Genetic diversity and genomic signatures of selection among cattle breeds from Siberia, eastern and northern Europe // Animal Genetics. – 2016. – Vol. 47. – № 6. – P.: 647-657 (doi:10.1111/age.12473).
18. Brito L.F., McEwan J.C., Miller S.P., Pickering N.K., Bain W.E., Dodds K.G., Clarke S.M. Genetic diversity of a New Zealand multi-breed sheep population and composite breeds’ history revealed by high-density SNP chip // BMC genetics. – 2017. – Vol.18. – № 1. – P.: 25 (doi:10.1186/s12863-017-0492-8).
19. Kharzinova V.R., Dotsev A.V., Solovieva A., Wimmers K., Reyer H., Brem G., Zinovieva N.A. PSVIII-23 High-density SNP marker based genetic diversity and population structure study of reindeer populations // Journal of Animal Science. – 2019. – Vol.97. – №3. – P.: 265-266 (doi:10.1093/jas/skz258.540).
20. Ribani A., Taurisano V., Karatosidi D., Schiavo G., Bovo S., Bertolini F., Fontanesi L. Signatures of Admixture and Genetic Uniqueness in the Autochthonous Greek Black Pig Breed Deduced from Gene Polymorphisms Affecting Domestication-Derived Traits // Animals: an open access journal from MDPI. – 2023. – Vol.13. – №11. – P.: 1763 (doi:10.3390/ani13111763).
21. Ozdemir M., Motmain Z., Ekinci K., Saygılı E. Associations Between BLG, CSN3, DGAT1, GH, PIT1, and PRL Gene Polymorphisms and Milk Production Traits in Holstein Dairy Cows: A MetaAnalysis // Biochemical genetics. – 2024. (doi:10.1007/s10528-024-10706-8).
22. Sae-Foo P., Triwutanon S., Rukkwamsuk T. Detection of Booroola Polymorphism of Bone Morphogenetic Protein Receptor 1b and Embrapa Polymorphism of Growth Differentiation Factor 9 in Sheep in Thailand // Animals: an open access journal from MDPI. – 2024. – Vol.14 – №5. – P.: 809 (doi:10.3390/ani14050809).
23. Tumino S., Di Trana A., Valenti B., Bordonaro S., Claps S., Avondo M., Di Gregorio P. Polymorphism at the CSN1S1 Locus and Energy Intake Level Affect Milk Traits and Casein Profiles in Rossa Mediterranea Goats // Animals: an open access journal from MDPI. – 2023. – Vol. 13 – №12. – P.: 1982 (doi:10.3390/ani13121982).
24. Денискова Т.Е., Петров С Н., Сермягин А А., Зиновьева Н А. Поиск однонуклеотидных полиморфизмов, ассоциированных с экстерьерными показателями у ягнят, на основе данных полногеномного генотипирования // Достижения науки и техники АПК. – 2023. – Т. 37 – № 7. – С: 69-76 (doi:10.53859/02352451_2023_37_7_69).
25. Pogorevc N., Dotsev A., Upadhyay M., Sandoval-Castellanos E., Hannemann E., Simčič M., Antoniou A., Papachristou D., Koutsouli P., Rahmatalla S., Brockmann G., Sölkner J., Burger P., Lymberakis P., Poulakakis N., Bizelis I., Zinovieva N., Horvat S., Medugorac I. Whole-genome SNP genotyping unveils ancestral and recent introgression in wild and domestic goats // Molecular ecology. – 2024. – Vol. 33 – №1. – P.: e17190 (doi:10.1111/mec.17190).
26. Torres T.E., Castillo V.P., Calderón A.B. Molecular identification of Diptera of forensic importance with the gene (COI Barcode), La Paz Bolivia // Medicina Legal de Costa Rica. – 2020. – Vol.37 – №2. – P.: 93-101 (oi:10.1603/0022-2585-41.1.47).
27. Dotsev A.V., Koshkina O.A., Kharzinova V.R., Deniskova T.E., Reyer H., Kunz E., Mészáros G., Shakhin A., Petrov S., Medvedev D.G., Kuksin A., Bat-Erdene G., Munkhtsog B., Bagirov V.A., Wimmers K., Sölkner J., Medugorac I., Zinovieva N. Genome-Wide Insights into Intraspecific Taxonomy and Genetic Diversity of Argali (Ovis ammon) // Diversity. – 2023. – Vol.15 – №5. – P.: 627 (doi:10.3390/d15050627).
28. Бакоев Н.Ф., Кошкина О.А., Харзинова В.Р., Сермягин А.А., Зиновьева Н.А. Разработка и валидация тест-системы анализа полиморфизма полного митохондриального генома свиней // Международный научно-исследовательский журнал. – 2023. – №12 (138) (doi:10.23670/IRJ.2023.138.64).
29. Masila E.M., Ogada S.O., Ogali I.N., Kennedy G.M., Too E.K., Ommeh, C.S. Mitochondrial DNA D-Loop Polymorphisms among the Galla Goats Reveals Multiple Maternal Origins with Implication on the Functional Diversity of the HSP70 Gene // Genetics research. – 2024. – P.:5564596 (doi:10.1155/2024/5564596).
30. Rossetti C, Genualdo V, Incarnato D, Mottola F, Perucatti A, Pauciullo A. State of the art on the physical mapping of the Y-chromosome in the Bovidae and comparison with other species - A review // Animal bioscience. – 2022. – Vol.35 – №9. – P.: 1289-1302 (doi:10.5713/ab.21.0480).
31. Bichile D.L, Kharkar A.R., Menon P., Potnis-Lele M., Bankar M., Shroff G.A. Y chromosome:Structure and biological functions // Indian Journal of Basic and Applied Medical Research. – 2014. – №3 – P.: 152–160.
32. Escouflaire C., Capitan A. Analysis of pedigree data and whole-genome sequences in 12 cattle breeds reveals extremely low within-breed Y-chromosome diversity // Animal Genetics. – 2021. – Vol. 52. – №5. – P.: 725-729 (doi:10.1111/age.13104).
33. Pei S., Xu H., Wang L., Li F., Li W., Yue X. Copy number variation of ZNF280BY across eight sheep breeds and its association with testicular size of Hu sheep // Journal of animal science. – 2022. – Vol.100 – №9. – P.: skac232 (doi:10.1093/jas/skac232).
34. Clop A., Vidal O., Amills M. Copy number variation in the genomes of domestic animals // Animal Genetics. – 2012. – Vol.43 – №5. – P.: 503-517 (doi: 10.1111/j.1365-2052.2012.02317.x).
35. Cai H., Li X., Niu X., Li J., Lan X., Lei C., Huang Y., Xu H., Li M., Chen H. Copy number variations within fibroblast growth factor 13 gene influence growth traits and alternative splicing in cattle // Animal biotechnology. – 2024. – Vol. 35 – № 1. –P.: 2314104 (doi:10.1080/10495398.2024.2314104).
36. Гладырь Е.А., Зиновьева Н.А., Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Кудина Е.П., Эрнст Л.К., Брем Г. Оценка степени дифференциации эдильбаевской и калмыцкой пород овец по микросателлитам // Достижения науки и техники АПК. – 2013. – № 3. – С.: 68-70.
37. Денискова Т.Е., Гладырь Е.А., Зиновьева Н.А. Характеристика некоторых российских пород овец по микросателлитным маркерам // Актуальные проблемы гуманитарных и естественных наук. – 2016. – Т. 9–№ 1. – С.: 24-29.
38. Денискова Т.Е., Селионова М.И., Гладырь Е.А., Доцев А.В., Бобрышова Г.Т., Костюнина О.В., Брем Г., Зиновьева Н.А. Изменчивость микросателлитов в породах овец, разводимых в России // Сельскохозяйственная биология. – 2016. – Т. 51 – №6. – С: 801-810 (doi:10.15389/agrobiology.2016.6.801rus).
39. Денискова Т.Е., Соловьева А.Д., Костюнина О.В., Зиновьева Н.А. Динамика аллелофонда овец романовской породы на основании анализа микросателлитов // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2017. – №3 – С.: 5-6.
40. Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А. Характеристика овец Приполярья по микросателлитам и репродуктивным способностям // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. – 2024. – Т. 54 – №4. – С.: 76-87 (doi:10.26898/0370-8799-2024-4-9).
41. Chen M.H., Dorn S. Cross-amplification of microsatellites from the codling moth Cydia pomonella to three other species of the tribe Grapholitini (Lepidoptera: Tortricidae) // Molecular Ecology Resources. – 2010. – Vol.10 – №6. – P.: 1034–1037 (doi:10.1111/j.1755–0998.2010.02837).
42. Денискова Т.Е., Костюнина О.В., Волкова В.В., Зиновьева Н.А. Применение микросателлитных маркеров для идентификации представителей рода Ovis // Генетика и разведение животных. – 2018 – №3. – С.: 3-10 (doi:10.31043/2410-2733-2018-3-3-10)
43. Денискова Т.Е., Раджабов Н.А., Багиров В.А., Зиновьева Н.А. Влияние интродукции аллелей архара на генофонд таджикских аборигенных пород овец // Достижения науки и техники АПК. – 2020. – Т. 34 – №3. – С.: 41-45 (doi:10.24411/0235-2451-2020-10308).
44. Шералиев Ф.Д., Раджабов Н.А., Иолчиев Б.С., Рахимов Ш.Т., Махмадшоев А.Н. Анализ ДНК-Микросателлитов овец, разводимых в Республике Таджикистан // Peasant. – 2020. – №2(87) – С.: 79-81.
45. Юлдашбаев Ю.А., Чиндалиев А.Е., Нурбаев С.Д., Сейтпан К.М., Баймуканов Д.А., Ертай А. Генетическая структура популяции овец казахской тонкорунной породы по молекулярно-генетическим маркерам ДНК // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2020. – №3. – С.: 2- 7 (doi:10.26897/2074-0840-2020-3-2-7).
46. Бекетов С.В., Коноров Е.А., Пискунов А.К., Воронкова В.Н., Каштанов С.Н., Денискова Т.Е., Кошкина О.А., Селионова М.И., Столповский Ю.А. Популяционно-генетическая характеристика тувинских короткожирнохвостых овец // Генетика. – 2022. – Т.58 – №3. – С.: 332- 342 (doi:10.31857/S0016675822030031).
47. Иванникова А.В., Соловьева А.Д., Денискова Т.Е. Характеристика аллелофонда овец южной мясной породы с использованием микросателлитных маркеров // Генетика и разведение животных. – 2023. – №4. – С.: 80-85 (doi:10.31043/2410-2733-2023-4-80-85).
48. Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А. Генетическая структура печорской популяции полутонкорунных овец по аллелям STR локусов // Достижения науки и техники АПК. – 2022. – Т.36 – №3. – С.: 91-96 (doi:10.53859/02352451_2022_36_3_91).
49. Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А. Анализ аллелофонда полутонкорунных овец печорской популяции с помощью STR-маркеров // Генетика. – 2023. – Т. 59 – №7. – С.: 843- 849 (doi:10.31857/S0016675823060103).
50. Широкова Н.В., Гетманцева Л.В., Бакоев Н.Ф. Продуктивные качества овец волгоградской породы различных генотипов гена CAST // Научная жизнь. – 2018. – №10. – С.: 164-172.
51. Лушников В.П., Фетисова Т.О., Стрильчук А.А. Полиморфизм гена CAST у овец татарстанской и эдильбаевской пород // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2020. – №2. – С.: 9-11.
52. Широкова Н.В., Казарова И.Г. Мясная продуктивность овец эдильбаевской породы разных генотипов по гену CAST // Вестник Мичуринского государственного аграрного университета. – 2022. –Т. 4 – №71. – С.: 170-173.
53. Дейкин А.В., Селионова М.И., Криворучко А.Ю., Коваленко Д.В., Трухачев В.И. Генетические маркеры в мясном овцеводстве // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2016. – Т. 20 – №5. – С.: 576-583 (doi: 10.18699/VJ16.139).
54. Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Зиновьева Н.А. Разработка и апробация тестсистемы определения полиморфизма генов DGKH и PPP1R1C, ассоциированных с живой массой овец // Аграрная наука. – 2023. – №12. – С.: 80-84 (doi:10.32634/0869-8155-2023-377-12-80-84).
55. Муханов Н.Б., Юлдашбаев Ю.А., Траисов Б.Б., Кудияров Р.И., Кожамуратов Н.Ж., Султанов О.С. Полиморфизм ДНК-маркеров мясосальных пород овец Казахстана по генам гормона роста (GH2) и инсулиноподобного фактора роста 1(IGF-1) // Вестник науки Казахского агротехнического университета им. С. Сейфуллина. – 2020. – Т.2 – №105. – С.: 52-58.
56. Куликова А.Я. Полиморфизм гена соматотропина (GH) у овец южной мясной породы // Сборник научных трудов Краснодарского научного центра по зоотехнии и ветеринарии. – 2023. – №12(1). – С.: 13-17 (doi:10.48612/sbornik-2023-1-4).
57. Горлов И.Ф., Сложенкина М.И., Колосов Ю.А., Широкова Н. В. Генетическая структура стада по генам GDF9, GH у овец Волгоградской и эдильбаевской пород // Аграрнопищевые инновации. – 2021.– №2 (14). – С.: 51-59 (doi:10.31208/2618-7353-2021-14-51-59).
58. Оздемиров А.А., Чижова Л.Н., Хожоков А.А., Суржикова Е.С., Догеев Г.Д., Абдулмагомедов С.Ш. Полиморфизм генов CAST, GH, GDF9 овец дагестанской горной породы // Юг России: экология, развитие. – 2021. – Т. 16. – №2(59). – С.: 39-44 (doi:10.18470/1992-1098-2021-2-39-44).
59. Селионова М.И., Чижова Л.Н., Суржикова Е.С., Подкорытов Н.А., Подкорытов А.Т. Полиморфизм генов CAST, GH, GDF9 овец горно-алтайской породы // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. – 2020. – №50(1). – С.: 92-100 (doi:10.26898/0370-8799-2020-1-11).
60. Скорых Л.Н., Суховеева А.В., Скокова А.В., Ефимова Н.И., Кононова Л.В. Полиморфизмы генов GH и GDF9, ассоциированные с показателями роста у овец породы манычский меринос // Ветеринария и кормление. – 2023. –№ 5. –С.: 73-77 (DOI: 10.30917/ATT-VK1814-9588-2023-5-18).
61. Селионова М.И., Чижова Л.Н., Суржикова Е.С., Петухова Д.Д., Светличный С.И. Полиморфизм генов PRL, Β-LG у овец породы лакон // Сборник научных трудов Краснодарского научного центра по зоотехнии и ветеринарии. – 2020. – №9 (1). – С.: 54-57 (doi:10.34617/e8nhz971).
62. Евлагина Д.Д., Селионова М.И. Связь генотипов по генам Β-LG и PRL с молочной продуктивностью овец породы лакон, составом и выходом сыра // Зоотехния. – 2022. – №4. – С.: 37-40 (doi:10.25708/ZT.2022.57.68.010).
63. Ibrahim M.F., Hassan R.D., Ahmed M.D., Haidan M. El-Shorbagy and Ramadan Wael A. Effect of Genetic Polymorphisms of the KAP1.1 and KAP1.3 Genes on Wool Characteristics in Egyptian Sheep // Journal of Biological Sciences. – 2018. – Vol. 18 – №4. – P.: 158-164 (doi:10.3923/jbs.2018.158.164).
64. Сенина Р.Ю., Калашникова Л.А., Лушников В.П., Цой К.К. Полиморфизм гена KAP1.3 у отечественных пород овец разного направления продуктивности // Овцы, козы, шерстяное дело. – 2019. – №4 – С.: 10-12.
65. Гаджиев З.К., Погодаев В.А., Суржикова Е.С., Евлагина Д.Д. Полиморфизм гена КАР 1.3 овец разных пород // Сельскохозяйственный журнал. – 2023. – №4(16). – С.: 86-95 (doi:10.48612/FARC/2687-1254/009.4.16.2023).
66. Халина О.Л., Магер С.Н., Гончаренко Г.М., Хорошилова Т.С., Гришина Н.Б. Генетическая структура овец западно-сибирской мясной и кулундинской тонкорунной пород по генам CAST, GDF9 И KRT1.2 // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. – 2022. – №4. – С.: 103-116 (doi:10.26897/0021-342X-2022-4-103-116).
67. Гаджиев З.К., Суржикова Е.С., Евлагина Д.Д., Суров А.И., Шумаенко С.Н. Оценка полиморфизма генов GDF9, BMP15 и их взаимосвязь с репродуктивными функциями овец разных пород // Юг России: экология, развитие. – 2023. – Т. 18. – №3(68). – С.:190-195 (doi:10.18470/1992-1098-2023-3-190-195).
68. Климанова Е.А., Коновалова Т В. Полиморфизм локуса ВМР-15 у овец романовской породы в условиях Западной Сибири // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2023. – №2(67). – С.: 197-204 (doi:10.31677/2072-6724-2023-67-2-197-204).
69. Денискова Т.Е., Шахин А.В., Esmailizadeh A., Доцев А.В., Зиновьева Н.А. Полиморфизм в генах-кандидатах, связанных с репродуктивными функциями у овец (Ovis spp.) // Сельскохозяйственная биология. – 2023. – Т. 58–№6. – С.: 1046-1056 (doi:10.15389/agrobiology.2023.6.1046rus).
70. Deniskova T.E., Dotsev A.V., E.A. Gladyr’, Sermyagin A.A., Bagirov V.A., Hompodoeva U.V., Il’In A.N., Brem G., Zinovieva N.A. Validation of the snp panel for parentage assignment in local Russian sheep breeds // Agricultural Biology. – 2015. – Vol. 50 – No.6. – P.:746-755 (doi:10.15389/agrobiology.2015.6.746rus).
71. Денискова Т.Е., Доцев А.В., Форнара М.С., Петров С.Н., Рейер Х., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А., Багиров В.А. Геномная характеристика межпородного семейства овец как основы для создания ресурсной популяции для идентификации QTL и генов-кандидатов, ассоциированных со скоростью роста // Генетика и разведение животных. – 2018. – №4. – С.: 16- 22 (doi:10.31043/2410-2733-2018-4-16-22).
72. Денискова Т.Е., Доцев А.В., Петров С.Н., Форнара М.С., Рейер Х., Виммерс К., Багиров В.А., Брем Г., Зиновьева Н.А. Геномная оценка и фенотипическая характеристика F2 ресурсной популяции овец // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. – 2019. – Т. 20. – № 5. – С.: 498-507 (doi:10.30766/2072-9081.2019.20.5.498-507).
73. Денискова Т.Е., Петров С.Н., Сермягин А.А., Доцев А.В., Форнара М.С., Reyer H., Wimmers K., Багиров В.А., Brem G., Зиновьева Н.А. Поиск геномных вариантов, ассоциированных с живой массой у овец, на основе анализа высокоплотных SNP генотипов // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – Т. 56. – №2. – С.: 279-291 (doi:10.15389/agrobiology.2021.2.279rus).
74. Кириченко А.В., Злобин А.С., Шашкова Т.И., Волкова Н.А., Иолчиев Б.С., Багиров В.А., Бородин П.М., Карссен Л.С., Цепилов Я.А., Аульченко Ю.С. Платформа GWAS-MAP|ovis для хранения и анализа результатов полногеномных ассоциативных исследований овец // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2022. – Т.26. – №4. – С.: 378-384 (doi:10.18699/VJGB22-46).
75. Криворучко А.Ю., Саприкина Т.Ю., Яцык О.А., Каниболоцкая А.А., Кухарук М.Ю. Гены-кандидаты и молекулярные маркеры, применимые для генотипирования секвенированием, ассоциированные с обхватом предплечья у овец породы джалгинский меринос // Зоотехния. – 2022. – №9. – С.: 5-8 (doi:10.25708/ZT.2022.24.75.002).
76. Зуев Р.В., Криворучко А.Ю., Кухарук М.Ю., Никитина А.В. Поиск геновкандидатов, ассоциированных с живой массой у овец северокавказской мясо-шерстной породы // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2023. – №1(66). – С.: 123-129 (doi:10.31677/2072-6724-2023-66-1-123-129).
77. Криворучко А.Ю., Сафарян Е.Ю., Каниболоцкая А.А., Степаненко В. А. Геныкандидаты, связанные с шириной груди у овец породы российский мясной меринос // Сельскохозяйственный журнал. – 2023. – № 4(16). – С.: 153-164 (doi:10.48612/FARC/2687-1254/015.4.16.2023).
78. Сафарян Е.Ю., Криворучко А.Ю., Каниболоцкая А.А., Шелудько П.А. Геныкандидаты, связанные с живой массой у овец породы российский мясной меринос // Достижения науки и техники АПК. – 2023. – Т.37. – №11. – С.: 43-48 (doi:10.53859/02352451_2023_37_11_43).
79. Денискова Т.Е., Доцев А.В., Зиновьева Н.А. Идентификация генов-кандидатов, ассоциированных с экономически значимыми признаками, на основе анализа островков гомозиготности в геноме пород овец, разводимых в России // Достижения науки и техники АПК. – 2023. – Т.37. – №9. – С.: 80-86.
80. Liu J., Zhang L., Xu L., Ren H., Lu J., Zhang X., Zhang S., Zhou X., Wei C., Zhao F., Du L. Analysis of copy number variations in the sheep genome using 50K SNP BeadChip array // BMC Genomics. – 2013. – №14. – P.: 229 (doi:10.1186/1471-2164-14-229).
81. Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Зиновьева Н.А. Вариация числа копий (CNV) как перспективный генетический маркер: распространение, методы валидации и гены-кандидаты в геномах сельскохозяйственных животных (обзор) // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. – 2020. – Т.21 – №4. – С.: 355-368 (doi:10.30766/2072-9081.2020.21.4.355-368).
82. Igoshin A.V., Deniskova T.E., Yurchenko A.A., Yudin N.S., Dotsev A.V., Selionova M.I., Zinovieva N.A., Larkin D.M. Copy number variants in genomes of local sheep breeds from Russia // Animal genetics. – 2022. – Vol.53 – №1. – P.: 119-132 (doi:10.1111/age.13163).
83. Dymova M.A., Zadorozhny A.V., Mishukova O.V., Khrapov E.A., Druzhkova A.S., Trifonov V.A., Kichigin I.G., Tishkin A.A., Grushin S.P., Filipenko M. L. Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Altai // Animal genetics. – 2017. – Vol. 48. – № 5. – P.: 615–618 (doi:10.1111/age.12569).
84. Wood N.J., Phua S.H. Variation in the control region sequence of the sheep mitochondrial genome // Animal genetics. – 1996. – Vol. 27. – №1. – P.: 25–33 (doi:10.1111/j.1365-2052.1996.tb01173.x).
85. Hiendleder S., Mainz K., Plante Y., Lewalski H. Analysis of mitochondrial DNA indicates that domestic sheep are derived from two different ancestral maternal sources: no evidence for contributions from urial and argali sheep // The Journal of heredity. – 1998. – Vol.89. – № 2. – P.: 113– 120 (doi:10.1093/jhered/89.2.113).
86. Pedrosa S., Uzun M., Arranz J. J., Gutiérrez-Gil B., San Primitivo F., Bayón Y. Evidence of three maternal lineages in Near Eastern sheep supporting multiple domestication events // Proceedings. Biological sciences. – 2005. – Vol.272 – № 1577. – P.: 2211-2217 (doi:10.1098/rspb.2005.3204).
87. Tapio M., Marzanov N., Ozerov M., Cinkulov M., Gonzarenko G., Kiselyova T., Murawski M., Viinalass H., Kantanen J. Sheep mitochondrial DNA variation in European, Caucasian, and Central Asian areas // Molecular biology and evolution. – 2006. – Vol. 23 – № 9. – P.: 1776-1783 (doi:10.1093/molbev/msl043).
88. Sanna D., Barbato M., Hadjisterkotis E., Cossu P., Decandia L., Trova S., Pirastru M., Leoni G. G., Naitana S., Francalacci P., Masala B., Manca L., Mereu P. The First Mitogenome of the Cyprus Mouflon (Ovis gmelini ophion): New Insights into the Phylogeny of the Genus Ovis // PloS one. – 2015. – Vol. 10. – №12. – P.: e0144257 (doi:10.1371/journal.pone.0144257).
89. Demirci S., Koban Baştanlar E., Dağtaş N. D., Pişkin E., Engin A., Ozer F., Yüncü E., Doğan S. A., Togan I. Mitochondrial DNA diversity of modern, ancient and wild sheep(Ovis gmelinii anatolica) from Turkey: new insights on the evolutionary history of sheep // PloS one. – 2013. – Vol. 8 – №12. – P.: e81952 (doi:10.1371/journal.pone.0081952).
90. Meadows J.R., Cemal I., Karaca O., Gootwine E., Kijas J.W. Five ovine mitochondrial lineages identified from sheep breeds of the near East // Genetics. – 2007. – Vol. 175 – № 3. – P.: 1371– 1379 (doi:10.1534/genetics.106.068353).
91. Wanjala G., Bagi Z., Kusza S. Meta-Analysis of Mitochondrial DNA Control Region Diversity to Shed Light on Phylogenetic Relationship and Demographic History of African Sheep (Ovis aries) Breeds // Biology (Basel). – 2021. – Vol. 10 – № 8. – P.: 762 (doi: 10.3390/biology10080762).
92. Tan Y.Z., Dingkao R., Li D., Yang S., Chunnian L. Characterization of the complete mitochondrial genome of the Qiaoke sheep (Ovis aries) // Mitochondrial DNA. Part B, Resources. – 2021. – Vol.6 – №4. – P.: 1514-1515 (doi: 10.1080/23802359.2021.1914519).
93. Brake M.H., Migdadi H.M., Sadder M.T., Awabdeh S., Jawasreh K., Obeidat W., Al Omari R., Haddad N.J. Complete mitochondrial genome sequence of Awassi-Jo sheep breed (Ovis aries) in Jordan // Mitochondrial DNA. Part B, Resources. – 2021. – Vol.6 – № 3. – P.: 1263-1264 (doi: 10.1080/23802359.2021.1906179).
94. Мухаметжарова И.Е., Исламов Е.И., Тарлыков П.В. Генетическое разнообразие и филогенетический анализ пород овец разных генотипов на основе анализа митохондриальной ДНК // Новости науки в АПК. – 2018. – Vol.2-1 – №11. – P.: 415-418 (doi:10.25930/f3rv-5m08).
95. Tarlykov P., Atavliyeva S., Auganova D., Akhmetollayev I., Loshakova T., Varfolomeev V., Ramankulov Y. Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Kazakhstan: evidence for early sheep introduction // Heliyon. – 2021. – Vol.7 – № 9. – P.: e08011 (doi: 10.1016/j.heliyon.2021.e08011).
96. Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Доцев А.В., Kunz E., Upadhyay M., Krebs S., Соловьева А.Д., Medugorac I., Зиновьева Н.А. Оценка материнской изменчивости российских локальных пород овец на основе анализа полиморфизма гена цитохрома B // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – Т. 56.– №6. – С.: 1134-1147 (doi:10.15389/agrobiology.2021.6.1134rus).
97. Бакоев, Н.Ф. Характеристика генетических и продуктивных особенностей овец тонкорунных пород: специальность 06.02.07 "Разведение, селекция и генетика сельскохозяйственных животных": диссертация на соискание ученой степени кандидата сельскохозяйственных наук / Бакоев Некруз Фарходович; ФГБОУ ВО «Донской государственный аграрный университет». - Персиановский, 2021, - 115 с. - Библиогр.: с. 58-65. - Место защиты: ФГБОУ ВО «Донской государственный аграрный университет. - Текст: непосредственный
98. Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Зиновьева Н.А. Разработка и апробация тестсистемы для выделения полных митохондриальных геномов домашних овец // Достижения науки и техники АПК. – 2022. – Т.36 – №10. – С.: 60-65.
99. Koshkina O., Deniskova T., Dotsev A., Kunz E., Selionova M., Medugorac I., Zinovieva N. Phylogenetic Analysis of Russian Native Sheep Breeds Based on mtDNA Sequences // Genes. – 2023. – №14. – P.: 1701 (doi:10.3390/genes14091701).
100. Meadows J.R., Hanotte O., Drögemüller C., Calvo J., Godfrey R., Coltman D., Maddox J.F., Marzanov N., Kantanen J., Kijas J.W. Globally dispersed Y chromosomal haplotypes in wild and domestic sheep // Animal genetics. – 2006. – Vol.37. – № 5. – P.: 444-453 (doi:10.1111/j.1365-2052.2006.01496.x).
101. Meadows J.R., Kijas J.W. Re-sequencing regions of the ovine Y chromosome in domestic and wild sheep reveals novel paternal haplotypes // Animal genetics. – 2009. – Vol. 40 – №1. – P.: 119- 123 (doi:10.1111/j.1365-2052.2008.01799.x).
102. Parmaksiz A., Oymak A., Yüncü E., Demirci S., Koban Baştanlar E., Özkan Ünal E., Togan İ., Özer F. Türkiye’den 12 Yerli, Karagül, Karacabey Merinosu ve Anadolu Yaban Koyununda (Ovis gmelinii anatolica) Y-Kromozom // Polimorfizmleri. Kafkas Univ. Vet. Fak. Derg. – 2018. –№24. – P.: 821– 828 (doi:10.9775/kvfd.2018.19962).
103. Ferencakovic M., Curik I., Pérez-Pardal L., Royo L.J., Cubric-Curik V., Fernández I., Álvarez I., Kostelic A., Sprem N., Krapinec K., et al. Mitochondrial DNA and Y-Chromosome Diversity in East Adriatic Sheep // Animal genetics. – 2013. – Vol. 44. – P.: 184–192 (doi:10.1111/j.1365-2052.2012.02393.x).
104. Wang Y., Xu L., Yan W., Li S., Wang J., Liu X., Hu J., Luo Y. Y Chromosomal Haplotype Characteristics of Domestic Sheep (Ovis aries) in China // Gene. – 2015. – № 565. – P.: 242–245 (doi:10.1016/j.gene.2015.04.015).
105. Deng J., Xie X.-L., Wang D.-F., Zhao C., Lv F.-H., Li X., Yang J., Yu J.-L., Shen M., Gao L., et al. Paternal Origins and Migratory Episodes of Domestic Sheep // Current biology: CB. – 2020. – №30. – P.: 4085–4095.e6 (doi: 10.1016/j.cub.2020.07.077).
106. Чинаров Р.Ю., Луканина В.А., Сингина Г.Н., Позябин С.В. Использование технологии opu/ivp для сохранения отечественных пород молочного крупного рогатого скота. В сборнике: Передовые достижения науки в молочной отрасли. Сборник научных трудов по результатам работы IV Международной научно-практической конференции, посвящённой дню рождения Николая Васильевича Верещагина. 2022. С. 56-59
107. Луканина, В.А. Экспериментальное обоснование технологии получения и трансплантации эмбрионов овец: специальности 4.2.5 "Разведение, селекция, генетика и биотехнология животных", 4.2.1 – "Патология животных, морфология, физиология, фармакология и токсикология": диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук / Луканина Виктория Александровна; Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста". - Дубровицы, 2023, - 137 с. - Библиогр.: с. 73-75. - Место защиты: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста". - Текст: непосредственный
108. Singina G.N., Shedova E.N., Chinarov R.Yu., Lukanina V.A., Pozyabin S.V., Shumakov N.I., Cherkasova O.V., Bagirov V.A., Gutsev I.V., Brem G.S., Zinovieva N.A. Hybrid lamb of domestic sheep and argali produced by somatic cell nuclear transfer // Reproduction, Fertility and Development. – 2022. – Vol. 35. – No 2. – P.: 134-135 (doi: 10.1071/RDv35n2Ab18).
Рецензия
Для цитирования:
Кошкина О.А., Денискова Т.Е. ДНК-маркеры и их использование в отечественном овцеводстве. Успехи наук о животных. 2024;1(1):25-41.
For citation:
Koshkina O.A., Deniskova T.E. DNA markers and their application in national sheep breeding. Ernst Journal of Animal Science. 2024;1(1):25-41. (In Russ.)